房颤如果并发脑卒中，大部分的情况下是比较严重的。
因为房颤脱落的栓子往往比较大，会导致大面积的脑栓塞发生，从而引起严重的后果，甚至因为严重的脑栓塞造成患者的死亡。房颤的患者一旦发生脑栓塞，要尽快到神经内科给予介入取栓治疗，及时地恢复脑动脉的灌注，能够有效地缓解病情和改善预后。
房颤的患者如果发生血栓栓塞的风险比较高，要长期服用抗凝的药物降低外周动脉栓塞发病的风险，有些房颤的患者还可以给予行射频消融手术以恢复窦性心律。