怀孕期间霉菌性阴道炎一般不会影响胎儿。因为霉菌不容易通过胎盘，一般不会发生胎儿子宫内感染。但有极个别的情况下，阴道上行性感染累及羊膜，有可能经羊水感染胎儿，引起流产、早产、绒毛膜羊膜炎等。
如果行阴道分娩，有极少数的可能会引起新生儿先天性皮肤念珠菌病、鹅口疮及寄生菌性红斑。怀孕期间一旦感染霉菌性阴道炎，一定要尽早治疗，以防孕妇经产道或上行感染胎儿或新生儿。
治疗上一般选用局部用药，可选择克霉唑栓阴道塞药，连用一周。平时保持外阴清洁干燥，用过的毛巾、盆及内裤，用开水烫洗。