马应龙痔疮栓是临床常用的痔疮药，副作用是比较小，但是对人体也有一些副作用，常见的有口干、便秘、排尿困难等。
因为马应龙痔疮栓里含有少量的麝香，如果是孕妇这种药栓是不可以使用的，有可能会导致引发流产或者引起不孕，因此在准备怀孕之前的女性要慎重使用马应龙痔疮栓。
马应龙痔疮栓是用各种清热解毒和活血化瘀的中药所制成，脾胃虚寒的人群用了这种药物后会加重脾胃的虚寒，有些患者还会出现的有腹泻症状，不能长期使用马应龙痔栓，使用的疗程要遵医嘱。