目前在临床上，对于多囊卵巢综合征的具体的确切的原因不明确，主要考虑有以下几个方面：
首先，是遗传因素。大部分的多囊卵巢综合征的女性是由于遗传因素所引起，具有家族史的人群，这样可能跟基因有关系。
其次，与外周的环境有关系。
最后，与胰岛素抵抗以及高胰岛素血症有一定的关系。因为高水平的胰岛素和卵巢内胰岛素样生长因子系统的协同作用，会使卵泡膜细胞上产生雄激素过多，因此会出现高雄激素的现象以及临床表现。而肾上腺功能表现过于旺盛，也会引起多囊卵巢综合征。
多囊卵巢综合征的女性常见于青春期和育龄期的女性，如果没有及时治疗，可以影响女性怀孕。