系统性红斑狼疮，具体的发病原因和发病原理还不完全清楚，但大多数专家认为是与遗传因素有一定关系，一般会有一定的家族遗传性，另外，患者体内也会存在有易感的一些基因，所以证明红斑狼疮是多种基因相关的一个疾病。
还有外在环境因素也起到一定的作用，例如阳光的照射，特别是紫外线使皮肤上皮细胞出现萎缩死亡，导致免疫功能的紊乱。
还有药物和化学试剂的刺激，一些微生物病原体等也会导致疾病的发生，雌激素的升高也导致疾病的发生，女性患者明显高于男性。