龟头流脓，一般情况下是因为泌尿系感染，尤其是下尿路的感染所导致。
患者发病之前往往会有不洁的性生活史，或使用过不干净的洗浴用品，从而出现病原体感染，使龟头出现脓液，比较常见的病原体是淋病奈瑟菌、衣原体以及支原体。
此外龟头流脓的患者往往伴有包皮过长或包茎，当个人不注意局部卫生，对包皮内的包皮垢没有做到及时清洗，可以导致包皮龟头炎的出现，当包皮龟头炎激发感染之后可以出现比较小的溃疡，并且有恶臭的乳白色的脓性分泌物形成，此时控制感染后下一步治疗应该考虑行包皮环切手术治疗。