长期吃药治疗肺结核可能有副作用，会对身体有一定程度伤害。肺结核的治疗需要早期、全程、规律治疗，需要联合几种抗结核药物，以达到消灭结核菌，避免耐药的产生。
治疗通常需要六到九个月甚至更长的时间，这些抗结核药物有各自副作用，如肝功能损害、神经损害、消化道症状等，不同人对其反应不同。正规治疗会根据患者病史选择适当药物，或让患者同时服用其它药物抵消部分副作用。
患者在服药期间，需要定期监测肝功能、检查视力，留意自己出现的不适并及时报告医师，来确保及时调整用药。虽然服药可能会有副作用，但肺结核对身体危害大，不能害怕副作用便拒绝治疗。