小儿免疫缺陷包括原发性免疫缺陷和继发性免疫缺陷，需要根据不同的类型进行针对性的治疗。
1.原发性免疫缺陷。主要是孕期感染病毒导致胎儿宫内感染，从而导致免疫系统先天性发育不良，需要通过常规药物进行治疗以外，还要针对不同的免疫缺陷性疾病进行治疗。比如血小板减少症免疫缺陷，可以通过转移因子疗法进行治疗。胸腺发育不良的患儿，可以采用胸腺素进行治疗。
2.继发性免疫缺陷。一般可以采用相关药物进行治疗，比如免疫球蛋白，而且预后也比较好，基本上都可以得到治愈或缓解。