12岁小孩头疼是可以吃药的。建议根据具体头疼的原因，遵医嘱对症用药。
如果是因为神经性因素导致的偏头痛，可以选择谷维素片或者复合维生素B等，营养大脑神经，帮助小孩改善上述症状。如果持续不缓解，可以遵医嘱适量地服用止痛药布洛芬缓解。同时也注意调整生活方式和睡眠习惯等，有助于缩短病程。
如果是因为感冒、发烧导致的头疼，建议遵医嘱口服抗感冒药物的同时，如果体温超过38.5℃可以适当地服用对乙酰氨基酚口服液缓解，从而改善头疼症状。