对于输尿管结石导致的肾盂积水危害主要有两方面，一是导致感染，二是导致肾盂积水加重、损害肾脏功能，因为输尿管结石坎顿在输尿管当中，会导致肾盂内尿液无法下行，通过输尿管进入到膀胱尿道排出体外，长期以往会导致肾盂内尿液浑浊。同时肾盂内压力增高，那么尿液浑浊，会导致感染风险增加，感染风险增加促进结石的形成，同时结石存在也会进一步加重感染，二者相辅相成。
如果肾盂内尿液长期以往浑浊以及肾盂内压力增高，会引起肾盂肾炎以及脓肾的形成，对于肾盂内压力过高，会压迫肾实质，最后导致肾功能受损，如果在晚期会导致无功能肾。