目前并没有特效的药物能够控制乳腺单纯囊肿，能够消除囊肿或者避免囊肿继续变大，手术是根治乳腺单纯囊肿病变的唯一途径。
该病变为良性病变，大多数患者临床症状不明显，对于这些患者可以考虑不用治疗，注意随诊观察即可。平时注意保持良好生活、饮食习惯，减轻对乳腺病变的刺激，尽量降低患者症状发生几率。
由于囊肿持续变大，有可能导致患者出现乳腺疼痛等症状。此时在就医检查确诊后，可以在医生指导下服用疏肝理气的药物，促进患者症状消退，降低病变对患者生活的影响。对于保守治疗效果不好的患者，建议手术治疗。