射精输精管疼，一般是由于输精管狭窄或者堵塞引起。因为这时射精，精液会压迫输精管狭窄堵塞部位，从而引起输精管疼痛，多半和输精管囊肿、输精管炎症有关。
另外，部分患有输尿管疾病人群，比如尿道结石、尿道囊肿人群，输尿管比较肿大，这时会压迫输精管，使输精管变得狭窄，此时同样会引起输精管疼痛。
所以，应当做输精管彩超和尿常规检查明确具体致病原因，然后积极给予治疗。患病期间要减少对输精管的压迫，否则会加重输精管疼痛症状。