孩子的矮小最常见的原因是由于生长激素分泌不足所导致。
这是引起孩子矮小的主要原因，生长激素有完全缺乏，还有一些是部分缺乏，还有以下这些因素，内分泌的疾病、先天性甲状腺功能低下、性早熟、遗传性的因素、家族性的矮小，生长激素分泌正常，家族的原因出现身材均匀的矮小也叫特发性矮小。
先天性的遗传代谢性疾病有先天性肾上腺皮质增生、软骨发育不良等，先天性的染色体异常的疾病特纳综合征、严重的营养不良、长期受到虐待、宫内发育迟缓都可以引起矮小。