马蹄肾可能和尿蛋白高有一定的关系。因为马蹄肾通常会对肾脏造成损伤，导致肾脏滤过功能受损，就会使大量的蛋白通过肾脏的滤出进入尿液当中，尿蛋白就会增高。
此外，长期存在马蹄肾，还有可能会引起肾积水、尿路感染、尿路结石等并发症。在严重时可能会导致肾衰竭，会使肾脏的功能严重受损。
因此，在确诊为马蹄肾以后，应尽早予以治疗。如果合并有结石或者感染，应进行取石、排石或者抗感染处理。对于病变比较严重的马蹄肾，在必要时应当将病变的肾脏予以切除。