淋巴结结核治疗多是采用全身的化疗为主，如果治疗效果不明显，而且病情引发了并发症，可以采用手术治疗。
手术治疗有局限性，一般是针对引发的并发症，如淋巴结肿大并化脓或引起瘘管和瘘道，可以采用的手术治疗。
另外，如果淋巴结肿大，已经压迫气管或或食管，导致呼吸困难或是吞咽困难，而经过化学治疗后效果并不好，可以采用手术进行治疗。淋巴结节肿块儿比较大，抗结核治疗后效果不明显，患者也可以采用手术切除。
如果淋巴结结核侵入到肠管，容易形成肠瘘或肠穿孔等并发症，就需要及时手术进行手术的相关治疗。