先天性虹膜异色是由遗传决定的，目前没有有效的治疗方法，不能治愈。
临床表现为双眼虹膜颜色不一致，但无其它不适，眼部与其它损害，因此可不用治疗。若为眼部疾病导致了后天获得性虹膜异色，比如Fuchs虹膜异色综合症。
本病是以虹膜脱色素为特征的慢性非肉芽肿性葡萄膜炎，患者表现为眼前黑影、视物模糊。本病治疗上主要是使用糖皮质激素及非甾体类消炎药抗炎对症治疗，本病常反复发作，不容易治愈。