女性尿道疼痛的常见原因是患有泌尿道感染、结石。由于致病菌感染引起的炎性反应、结石对尿道的机械性刺激损伤等，都有可能出现尿道疼痛、不适感觉。
也不排除妇科疾病引起的尿道疼痛，由于女性的尿道开口和阴道开口位置邻近，妇科阴道、宫颈等部位感染，炎性分泌物排出污染尿道也可发生尿痛感觉。
可结合伴随症状以及观察白带性状变化，辅助尿液常规化验、泌尿道超声、妇科取白带标本化验检查。根据检查结果提示，针对性给予足够疗程喹诺酮类药物进行抗炎治疗，经尿道取石等治疗措施治疗即可。