在通常情况下，新冠的肛拭子采样呈假阳性的几率相对较低。
新冠的肛拭子采样是一种行之有效的采样方式，准确率要比鼻咽拭子和口咽拭子相对要高。因为新冠病毒有可能在消化道内进行存留，也会随着粪便排出体外，因此有一部分病毒会通过采取直肠内标本的方式和方法将其寻找到，也可以通过这种检查的方式来判定患者是否罹患有新冠病毒肺炎。
在进行肛门拭子采集的时候，通常沿着直肠壁插入肛门3~4cm左右，约10秒钟左右的时间进行采样。