需要根据水疱的病因，使用不同的口服药物治疗。
如果是烧烫伤引起的水疱，可以口服抗菌消炎的药物，再加上外用的药物，水疱可以自行吸收，慢慢痊愈。如果是病毒感染引起的水疱，如水痘、单纯疱疹或者带状疱疹等，需要口服无环鸟苷类抗病毒药物，如阿昔洛韦片或者伐昔洛韦片，再加上局部外用的抗病毒的药物，水疱可以逐渐干涸、结痂、痊愈。
如果是自身免疫性的疾病，如天疱疮等引起的水疱，则需要口服糖皮质激素类药物，如泼尼松等，同时再配合外用药物治疗，病情可以得到控制。