肠瘘与肠穿孔首先在定义上进行区别，肠瘘是指肠道与肠道之间或者肠道与其它组织器官，或与腹壁出现不正常的通道，造成了腹腔内容向肠道之外排出，从而引起一系列的并发症，如感染、体液的丢失、酸碱失衡、离子紊乱、营养不良等情况，一般是一个较长期的过程。
而肠穿孔是指胃肠道的疾病，例如胃、十二指肠的溃疡、肠道的肿瘤病变，所导致的肠管壁出现破坏，导致肠内容物溢出至腹膜腔的过程。
它主要是很多肠道疾病的并发症，主要临床表现为剧烈腹痛、腹胀、腹膜炎等症状体征，严重可导致休克，一般病情较急。