普通肺炎和流感肺炎的治疗方法是不一样的，因为两者的病原体不同，所以使用的抗病原体的治疗方法不一样，其他包括补液退热止咳平喘等处理基本上是一样的。
普通肺炎，最多见的是细菌性的肺炎，需要根据可能感染的不同细菌选择不同的抗生素，常用的有β内酰胺类，喹诺酮类药物，大环内酯类药物等等。
流感肺炎，是由流行性感冒病毒引起来的。流感肺炎需要使用抗病毒药物，奥司他韦是比较常用的神经氨酸酶抑制剂。
不管是普通肺炎还是流感肺炎，如果患者病情进展快，出现并发症呼吸衰竭，通常都是需要供氧，甚至是机械通气治疗。