中医认为口腔溃疡是因体内正气不足，外邪侵犯和胃热引起，可通过服用麦冬、金银花、玄参、大黄、黄芪类中药治疗，也可选择含有这类药材的中成药物，比如口炎清颗粒、一清胶囊等，具有清热解毒、滋阴泻火类效果，可有效促进溃疡愈合。
而西医认为口腔溃疡是因多种因素综合性作用导致，比如体内缺乏维生素、身体免疫力下降、​局部创伤、精神紧张、体内激素水平改变、口腔微量生物增生等。
可通过局部用药或全身性用药治疗，如选择西瓜霜喷剂、冰硼散、含漱剂等，也可服用免疫制剂和复合型维生素，预防和治疗口腔溃疡。