肛门脓肿不会导致精囊脓肿，精囊属于男性泌尿生殖系统器官，位于膀胱后方，而肛门脓肿属于普外科疾病范畴。
肛门脓肿主要是肛旁脓肿，由于肠道内的细菌通过肠周围间隙以及渗入到肌肉到达皮肤，从而形成瘘道或者肛旁脓肿的形成。对于此类脓肿，除非是由于肠道破溃侵犯精囊才会形成精囊脓肿。因此，一般是不会由于肛门脓肿引起精囊脓肿的。
患者如果存在肛门脓肿，需要去肛肠外科进行就诊，必要时进行手术治疗。而对于精囊脓肿需要去泌尿外科进行就诊,判断是脓肿还是囊肿，如果是脓肿，需要进行抗生素对症治疗。如果是囊肿，只需要对症观察即可。