手足口病严重后会威胁到生命，因为可能会出现循环衰竭，中枢神经系统疾病以及呼吸衰竭等疾病。
出现循环衰竭时，可能会导致患者出现血压下降、脸色苍白、心率增快等休克的临床表现。呼吸衰竭主要是引起呼吸困难，有可能会气促、喘息以及呼吸频率以及呼吸深度的改变。
出现中枢神经系统疾病后，如果不及时的治疗，虽然没有出现生命危险，但有可能会遗留后遗症。因此明确重型手足口病后需要立即住院治疗，以免出现上述的并发症。