房颤所诱发的疾病，最主要的就是血栓栓性疾病。房颤的患者大部分都心房内存在附壁血栓，一旦栓子脱落就可以造成器官栓塞性病变，常见的是脑栓塞、肺栓塞、肠系膜动脉栓塞。
房颤还可以诱发心绞痛、急性心肌梗死及心衰的发作，是因为发作房颤时心率都是偏快的，而心率过快可以进一步导致心肌的射血量减少，引起心脏本身和其它组织器官的供血不足，而且过快的房颤也可以出现血压的下降，这又进一步加重了，其它组织器官血液灌注不足的情况。
所以如果出现了快心率的房颤，要尽快的转为窦性心律，也要积极控制房颤的心室率。