十几年的肛瘘能治疗，得了肛瘘只有手术治疗才能治愈，十几年的肛瘘会由单纯性肛瘘变成了复杂性肛瘘。
有些病人肛周脓肿破溃流脓后，疼痛缓解就不急于诊治，这不对。有些肛瘘外口引流不畅或假愈合，会造成瘘管内再次感染化脓，有的又重新破溃流出脓液 ，形成复杂性肛瘘，使治疗难度加大，也使术后肛门功能更加受影响。肛门外口不断流出脓液，容易产生瘙痒和皮炎。
肛瘘长期不治疗，由于长期慢性炎症刺激还会出现癌变。所以得了肛瘘要早期及时治疗。