关于间质性膀胱炎的病因到现在不是十分的明朗，因为有多个因素可能会引起这种疾病，那么目前主流的一些病因假说呢，主要有一下几种，
1. 一个是营利性的感染。那么可以是病毒，可以使细菌，但是这些致病的一些病原体呢，目前还没有被鉴定出来，也有一部分人认为，这些感染主要是一个诱发因素。
2. 第二点是遗传性的因素，那么根据现有。一些统计学的调查发现，黑人的发病率相对来说比较低。那么北美人与日本人相比较的话，发病率是比较高，所以考虑改变呢可能与种族还有遗传，有一定的相关性。
3. 第三种假说是自身免疫性的因素。因为这种疾病的患者常常会合并其他自身的民性疾病。那么经过免疫制剂的治疗，可以部分改善。所以考虑这种疾病也有可能是一种自身的慢性疾病。其他一些假说，包括膀胱内的旁观内存的这个粘膜破坏，比如说钾离子，还有神经里面的一些炎症反应或者肥大细胞的火花等等都有可能会导致这种间质性的膀胱炎。