肛门有灼热感，如果是由于感染所引起，可以吃抗生素药物进行对症的治疗，比如头孢类的抗生素药物，年龄超过十八周岁的患者，还可以口服喹诺酮类的抗生素药物。肛门的局部还可以使用消毒剂进行涂擦，配合抗生素软膏进行局部的涂抹。
肛门有灼热感，除了要排除感染性的疾病以外，还要排除是不是由于直肠炎，或者是肛窦发炎等疾病所引起。如果是由于直肠炎、肛窦炎的因素，主要是以肛门的局部用药为主，可以使用中药制剂进行保留灌肠。比较常用的有康复新液，以及复方黄柏涂剂，在灌肠之后还可以适当地配合药膏和药栓直肠内给药。
同时，也要尽量地避免不良习惯的影响，避免疲劳熬夜的发生。