引起脑脓肿常见的病原菌包括金黄色葡萄球菌、变形杆菌、大肠埃希菌、白色念珠菌或者是链球菌，这些细菌在颅内容易生长形成脓肿。
其中金黄色葡萄球菌多位于皮肤的表面，所以外伤引起的脑组织暴露后，就会出现金黄色葡萄球菌侵入颅内，当治疗不彻底、治疗不及时的时候，这种细菌就会在颅内生长可能会引起脑脓肿。厌氧菌感染多发生于耳源性的脑脓肿、链球菌和白色念珠菌，则是通过血液的传播致颅内，从而引起脑脓肿的发生。
当发生颅内感染脑脓肿后，需要选择敏感的抗生素行抗感染的治疗脱水治疗，必要时行手术穿刺，或者是摘除脑脓肿，从而尽快地促使脑脓肿引起的肢体，以及神经功能障碍的恢复。