阴囊湿疹和真菌感染之间有明显区别，是两种完全不同的疾病，致病原因、临床症状、治疗方法都有所区别。
阴囊湿疹主要是由于局部过度潮湿，属于皮肤过敏的一种非特异性炎症反应。主要表现为出现丘疹、红斑，并伴有瘙痒，并会伴有渗出液。如果在慢性期，可伴有皮肤增厚苔藓样改变，主要用抗过敏的药物治疗。
真菌感染是感染真菌后所引起，在显微镜下可以找到有真菌，主要表现为红斑、脱屑、瘙痒。需要用口服抗真菌的药物，结合外用药物来进行治疗。