黏膜白色海绵状痣是一种良性病变，通常不会恶变，以药物治疗或手术治疗为主，可以选择局部涂抹全反式维a酸，消除斑块。
也可用有杀菌作用的药物用于皮肤伤口的消毒、清洗，比如氯己定，可用外用杀菌防腐剂使病变减轻消退，比如依沙吖啶。
对于感染者可用四环素、青霉素、制菌霉素、阿奇霉素等药物，也可用抗组胺药物，如氯雷他汀。也可用冷冻或激光等物理治疗方式小范围去除病变组织，针对病变范围局限的患者可以选择手术切除治疗，经正规治疗后预后良好。
有此病家族史的人群可做婚前检查、孕前检查、产前咨询、遗传咨询等，减少此病的发生。