结膜炎如果不进行治疗，也有可能会自愈。但是每个患者的体质不同，免疫功能也会有所不同，部分患者不进行治疗，可能会引发更严重的眼部疾病。所以结膜炎的患者，还是建议及时进行治疗。
结膜炎不严重的情况下，患者可以在医生的指导下使用左氧氟沙星滴眼液等药物来进行治疗，同时保持眼部的卫生，避免用手揉搓眼部，以免细菌感染的情况加重。如果结膜炎是比较严重的，可能需要全身性用药，比如口服抗生素等药物。
结膜炎一般是因为感染导致的，所以患者平时需要做好预防工作，尤其是佩戴隐形眼镜的患者，需要每天对镜片进行消毒处理。