男性不育的原因也有很多常见的由染色体发育的异常、免疫系统抗体方面的因素，内分泌的失调、性功能的障碍、阳痿等。精液的质量差是常见的原因，为精子质量的异常。临床表现为少精症、弱精症、无精子症、精液不液化等。还可以有输精管的堵塞精索静脉的曲张精子的异常精子的过敏射精的障碍等。
另外如果男性过度肥胖长期喝酒吸烟、酗酒、吸毒都会导致精子质量的异常。还有一些药物的滥用，不少药物中含有可卡因可卡因会使男性的精子数目减少，长期连续服用该药会导致生精功能障碍。再就是过度频繁的性，生活和不洁的性生活也会导致不育。