假性肠梗阻和真肠梗阻的发病原因，表现等各方面不太相同，可以结合病人的表现和仪器检查鉴别。
假性肠梗阻，没有实际的物质堵塞肠道，由于神经抑制，毒素刺激等引起肠道的肌肉运动功能出现异常，从而有肠梗阻的现象。而真肠梗阻，是因为肠道的神经系统平衡失调，或者肠道局部神经传导异常，引起肠蠕动消失。
真肠梗阻和假性肠梗阻的鉴别诊断，可以使用仪器检查鉴别，通过X射线检查，真肠梗阻表现为普遍胀气，而假性肠梗阻影像中不会显示肠胀气与气液面。