输精管堵塞可能为先天性，也可为生殖系统疾病、手术损失所导致。
先天性所导致的输精管堵塞，主要是由于输精管出现发育不良或输精管缺失所引起。如果男性患有生殖系统结核疾病，比如急慢性的附睾炎，会导致输精管出现炎症以及纤维化，不及时的进行治疗就会使输精管堵塞，外伤、手术损伤、输精管损伤也会引起输精管堵塞。
输精管堵塞患者应当去医院做详细的体格、影像学、遗传学等检查。先天性因素所导致的输精管堵塞，通常无法进行手术疗法。其它因素所引起的输尿管堵塞，通过手术治疗能够使输精管通畅。