舌毛状白斑的治疗方法通常是选择药物治疗，根据舌毛状白斑的感染的病原菌不同，选择不同的治疗药物。
如果是因为白色念珠菌感染所导致的，可以选择抗真菌药物，如制霉菌素、酮康唑、益康唑、伊曲康唑。如果是EB病毒所导致的，可以选择阿昔洛韦等药物。同时一定要抑制上皮增殖，可用维甲酸，维持细胞正常功能，防止过度角化。一般毛状白斑通常发生在免疫力比较低的人群，好发于艾滋病患者。所以如果是艾滋病患者，一定要积极进行抗艾治疗，增强自身抵抗力。
出现口腔表面毛毯状白斑或者是疼痛、地图状等症状时一定要及时就医，通过组织病理学检查等明确诊断，及时治疗。在日常生活中要增强体育锻炼、注意保暖、饮食均衡。要注意用药时一定要在医生指导下用药，不可以随便停药，也不要加大剂量用药，以免造成肝功能肾功能等损伤，要定期复查，及时调整用药。