单纯疱疹和病毒性疱疹的区别，在于感染的病原体，以及皮肤表面的形态。
从感染病原体的角度，单纯疱疹感染的一般是单纯疱疹一型病毒，或者单纯疱疹二型病毒。而病毒性疱疹包括的种类则比较多，不但包括单纯疱疹，还包括其他的一些疱疹。比如疱疹性咽峡炎，主要是由其他的一些病毒种类感染导致，而水痘-带状疱疹病毒感染的带状疱疹，也属于病毒性疱疹的一种。
而从临床症状角度考虑，单纯疱疹主要会在口周，或者是身体皮肤表面，出现一些孤立性的水疱，或者密集排列的小水疱，伴随着庆祝的灼热和疼痛。而病毒性疱疹，则依据其感染的病毒种类，表现各不相同。