小儿肠套叠治疗方法包括非手术治疗及手术治疗。
非手术治疗适用于小儿肠套叠发生后48小时内，全身情况良好、腹部不胀、无明显脱水症状的患儿。主要方法有在X线监测下空气灌肠和B超监视下水压灌肠，以水灌肠治疗最常使用，优点为没有辐射，而且复位率高。
不符合非手术治疗指征的患儿或者非手术复位方式复位失败的患儿，可采取腹腔镜微创手术或者开腹手术治疗。开腹手术损害大，一般怀疑患儿肠管坏死、穿孔，伴发腹膜炎时才使用。