肛瘘手术严重的会引起肛门失禁的表现，大多数肛瘘手术是不会造成相关的症状表现的。肛瘘手术分为多种临床上常用的手术包括肛瘘切除术、挂线疗法、瘘管切开术。
肛瘘可分为肛管括约肌间型、经肛管括约肌型、肛管括约肌上型、肛管括约肌外型肛瘘。手术时根据瘘管部位可能会对肛门括约肌造成一定的影响，导致括约肌功能下降，影响到肛门括约肌的功能，同时有的会切断肛门括约肌。因此术后大便失禁除外肠道感染腹泻原因多为括约肌功能受损引起，可观察一段时间，必要时进行复诊。