先天性鳃裂瘘管属于比较严重的一种疾病。本病患者常无明显的自觉症状，仅表现为颈部包块或者因继发感染出现疼痛时才引起注意。
患者常表现为颈部瘘口分泌物，颈部包块和反复感染。本病可以分为第一、二、三、四鳃裂瘘，瘘口的开口部位不同。比如第一鳃裂瘘，内瘘开口位于外耳道，外瘘开口可在下颌角附近，也可在耳垂后下部。第二鳃裂瘘口可在扁桃体窝上后方，外瘘口可位于胸锁乳突肌前缘下方。
由此可见，鳃裂瘘管的病变范围较广，本病主要是采取手术治疗。因此手术的创伤也比较大，相对较为严重。