小儿胃肠炎和胃肠型感冒在病因、症状、治疗方面都有所不同：
第一，病因不同。小儿胃肠炎有可能由于过度饮食导致，也有可能由于胃肠黏膜感染病毒或细菌导致。而胃肠型感冒主要是由于腹部受寒致胃肠功能紊乱，或病毒感染上呼吸道引发胃肠道症状。
第二，症状不同。小儿胃肠炎以消化道症状为主，比如呕吐、腹泻、腹痛等。也有一部分患儿会伴有发烧的症状出现。胃肠型感冒主要表现为胃肠道症状以及上呼吸道症状，比如恶心、呕吐、一般不会腹泻，同时还会伴有打喷嚏、流鼻涕等症状。
第三，急性胃肠炎需要针对病因进行治疗，而胃肠型感冒主要是以对症治疗为主。