胃镜是检查消化溃疡首选的方法。可以确定有无病变，部位及分期，鉴别良恶性溃疡。评价治疗的效果，对合并出血者可以在胃镜下进行止血治疗。合并狭窄梗阻的病人可以给予扩张或支架治疗。超声内镜检查可以评估胃或十二指肠壁，溃疡深度。病变与周围器官的关系，淋巴结数目和大小等。对胃溃疡应常规在溃疡边缘取活检。x线钡餐造影，因为内镜技术的普及和发展，上消化道钡剂造影现在用的越来越少，但钡剂照影适宜了解胃的运动情况。不能做胃镜的病人，不愿意接受胃镜检查和没有胃镜检查条件时。气钡双重造影能较好的显示胃肠粘膜形态。但是无法通过活检进行病理诊断，对穿透性溃疡或穿孔CT很有价值。可以发现穿孔周围炎症、包块、积液、对于游离气体的显示甚至优于立位胸片。对幽门梗阻也有鉴别诊断的意义。
消化性溃疡无论溃疡处于活动还是瘢痕期。都需要做幽门螺杆菌的检测。另外血常规，粪便隐血对于了解消化性溃疡有无活动性出血有意义。