骨髓增生异常综合征的患者，由于病人存在着病态造血、无效造血，具有正常免疫功能的白细胞数可以出现下降，病人免疫力下降容易导致感染，所以病人有可能会出现咳嗽、咳痰、发热，有的时候有可能会出现尿频、尿急、尿痛、腹痛、腹泻等，严重的时候甚至有可能会导致败血症的发生。
患者还有可能会出现血小板的减少，可以出现皮肤的紫癜，也有可能会出现鼻出血、牙龈出血，部分患者甚至有可能会发生吐血、呕血、便血、尿血等。
骨髓增生异常综合征的患者，如果是发生贫血比较严重，也有可能会导致贫血性心脏病的发生，病人有可能在平静的状态下出现端坐呼吸，有可能会出现心率增快、心律不齐等。