异位胰腺长在胃窦部，有以下几方面的危害：
第一，如果异位胰腺体积比较大，会压迫胃窦部，引起幽门的梗阻，压迫十二指肠乳头部，会引起胆管和胰管的梗阻，出现黄疸、腹痛的症状。
第二，异位胰腺如果长在胃黏膜下，会引起胃肠道黏膜出血、糜烂，严重的会侵犯血管，导致上消化道大出血可能。
第三，异位胰腺可以分泌胰蛋白酶，这种消化酶具有强烈的腐蚀性，会腐蚀胃壁，形成溃疡。
第四，异位胰腺可位于胃窦部的先天性的憩室内，严重的会引起憩室炎，并且出血、穿孔等一系列严重的并发症。