治疗膀胱结石前需要明确结石的病因，在处理结石的同时需针对原发病进行相应的治疗。女性膀胱结石常见的诱发因素有，营养不良、下尿路梗阻、感染、膀胱异物、代谢性疾病、尿道狭窄、膀胱颈部肿瘤等。治疗时需根据病情给予补充营养，解除下尿路梗阻，抗生素治疗以及针对膀胱肿物的治疗等。
对结石的治疗，原则是取净结石，小的结石可经尿道自行排出，较大结石不能自行排出者可行膀胱内碎石术。
碎石方法有体外冲击波碎石及液电冲击碎石、超声波石及碎石钳碎石。较大结石且无碎石设备者可行耻骨上膀胱切开取石术，对合并有膀胱感染者，应同时积极治疗炎症。