慢性鼻窦炎的原因和呼吸道感染有关，比如急性鼻炎。
鼻窦炎是因为上呼吸道病毒感染导致，急性期过后，鼻腔内引流不顺畅，分泌物必须经过抗炎抗病毒治疗，一旦没有完全缓解，并且此症状超过12周，可以确定还有慢性鼻窦炎，这和鼻腔鼻窦解剖结构，不利于充分引流有直接关系。
所以，如果再治疗急性鼻窦炎抗炎引流并不及时，药物疗程不够，都可以叫急性鼻窦炎，慢慢则会转变成慢性鼻窦炎。目前临床上治疗慢性鼻窦炎，首选药物治疗，首选青霉素类或头孢类药物。