盐酸氟桂利嗪胶囊比较常见的副作用是容易出现一些神经系统症状，如困倦、乏力、嗜睡、抑郁等。也有患者出现消化系统反应，如胃部反酸、烧心、体重增加、饥饿感增加等。有些老年人患者有锥体外系反应，如不自主运动、强直性动作等，偶见患者出现皮疹、肌肉酸痛、溢乳等。这些不良反应大都为短暂，停药后一段时间可以慢慢消失。
盐酸氟桂利嗪胶囊主要用于缓解脑血管痉挛，改善脑供血不足，治疗脑血栓形成术后和椎动脉缺血，还能用于抗眩晕和预防偏头痛。
本品需要在专业医生的指导下使用，严格执行医嘱，控制用药剂量。因本品有镇静作用，驾驶员和从事机械操作者要慎用，以免发生意外伤害。