肛周湿疹的发病原因复杂，是由内外因素造成的一种变态反应，还与遗传因素和自身身体素质有关。一般分为内因和外因2个方面：
1.内因：某些疾病如消化功能紊乱、精神紧张、失眠、过度疲劳、情绪波动以及内分泌失调、神经功能障碍等。肛门局部疾病，如痔疮、肛瘘、肛裂等肛肠疾病，慢性炎症刺激也会诱发肛周湿疹。
2.外因：外界刺激如紫外线、日光、炎热、寒冷、气候、生活环境的影响。肛门局部受到强酸、强碱、酒精刺激，而发生湿疹。