首先，二者的病因并不相同。
腰椎管狭窄可以由于多种原因引起，包括发育性的腰椎管狭窄、腰椎的退变造成的狭窄，还包括腰椎间盘突出导致腰椎管狭窄。另外，肿瘤感染、医源性原因都可以出现腰椎管狭窄。而腰椎间盘突出就是特指由于间盘突出，导致神经根或者是马尾受压产生的疾病。
其次二者的症状也是有差别的，腰椎管狭窄分为中央管狭窄、侧隐窝狭窄，以及椎间孔狭窄三种类型，相较于腰椎间盘突出来说，比较明显的区别就是中央管狭窄，会出现间歇性的跛行。而腰椎间盘突出并没有明显的这个症状。针对于恻隐窝狭窄、椎间孔狭窄常常会导致神经根受压，产生和腰椎间盘突出类似的症状。
治疗方面也是有区别的，腰椎管狭窄要进行广泛的椎管减压。腰椎间盘突出常常可以进行突出间盘的摘除手术。