肛瘘开刀恢复的时间一般是在3周~1个月左右。如果是一些较为严重的肛瘘，采用挂线的手术方法，恢复的时间甚至需要超过2个月，甚至是3个月的时间。
肛瘘一般在术后不进行缝合，属于开放性的创口，所以愈合的时间会较长。低位、单纯性的肛瘘，恢复的时间一般是在1个月左右。术后按时换药，保持创口引流的通畅，可以促进伤口的快速愈合。
一些高位、复杂性的肛瘘，需要采用挂线的手术方法。而且在手术以后需要进行二次，甚至是三次的紧线治疗，都会增加术后恢复的时间。在术后要保持创口的清洁，有利于创面的恢复。